论文查重就是将论文提交到检测系统中，系统会自动将提交的论文与原有的文献数据库比对，目的是检测论文中是否存在与他人已发表论文重合的部分，最后，系统会根据重合部分占论文比重的多少给出相应的重复率。重复率达到一定的限度，论文就会被认为存在抄袭剽窃等学术不端行为的嫌疑，从而产生相应的不良后果。
对于投稿的期刊论文：
（１）如果稿件仅在审稿过程中，未被录用，则通知第一作者，直接在本刊审稿平台中作退稿处理。
（２）如果稿件已被录用但未正式刊出，则以书面的形式通知稿件作者，取消该稿件的录用资格。
（３）如果已正式刊出，将择期在学报中刊出撤消该稿件的通告，并就此事件向第一作者或通讯作者所在单位通报。
（４）对认定为学术不端稿件的第一作者或通讯作者所撰写的稿件，３年内期刊将一概不予接收。
对于取得学位的毕业论文：
（1）如果论文正在撰写中，导师会要求不断修改，重复率不达标毕业论文不予通过，无法参加答辩，更不能毕业。
（2）对于研究生来说，如果多次查重检测不达标毕业申请被驳回，毕业延缓或更未严重的后果。
（3）更为严重的学术不端行为（如代写、抄袭剽窃等），会不予授予学位或撤销已有学位。
对于科研人员来说：
（1）通报批评；
（2）终止或者撤销相关的科研项目，并在一定期限内取消申请资格；
（3）撤销学术奖励或者荣誉称号；
（4）辞退或解聘；
（5）法律、法规及规章规定的其他处理措施。如：警告、记过、降低岗位等级等。
论文“作弊”作者一旦被裁定“知识诚信”方面有瑕疵，这种瑕疵像某些疾病一样，染上就要携带终身。所以，遵守学术道德规范，避免学术不端行为的出现，科研之路才能走的长远。
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