全球首个！川农在这项研究领域取得重大突破
3月3日，记者从四川农业大学获悉，川农草业科技学院黄琳凯教授团队在国际权威学术期刊《自然遗传学》（Nature Genetics）在线发表了题为“Pangenomics identifies structural variation associated with heat tolerance in pearl millet”（美洲狼尾草泛基因组构建、结构变异挖掘及耐热机制解析）的研究成果。
该研究构建了首个美洲狼尾草图形泛基因组，也是全球首个牧草领域图形泛基因组，将为牧草基因资源挖掘及育种提供重要资源。该研究还揭示了狼尾草耐热的分子机制，将为相关物种如玉米、小麦和水稻的耐热研究提供重要信息。该研究将在保障粮食安全、应对全球气候变暖等方面发挥重要作用。
据了解，美洲狼尾草，又名珍珠粟，全球种植面积约达3,100万公顷。在我国它是重要的饲草，是草食家畜和食草淡水鱼类的优质饲料和青料，其作为亲本的杂交狼尾草，目前在南方各省普遍种植，是单产最高的多年生牧草之一。在非洲、印度等热带干旱地区，美洲狼尾草是重要的杂粮作物。
如何用科技引领牧草产业发展，是黄琳凯教授团队长期研究的领域。由于牧草基因组大、重复序列及杂合度都较高，增加了基因组序列构建的难度。2019年，该团队还首次公布了鸭茅的高质量参考基因组，是我国公布的首个牧草参考基因组。随着研究的深入以及技术的进步，构建高质量的图形泛基因组成为团队的重要目标。
“与参考基因组相比，图形泛基因组包含的遗传信息更全面，通过发掘结构变异，能够更好地解析植物表型和农艺性状的不同，为下一步育种奠定重要的研究基础。”黄琳凯教授介绍。
通过联合国内外多家单位，本次研究从全球8个地区收集的394份美洲狼尾草核心种质中选取10份代表性材料，利用Pacbio HiFi等技术进行基因组从头组装，获得了高质量的基因组组装序列，结合一个已报道的基因组构建了首个美洲狼尾草图形泛基因组，发掘到424,085个结构变异。基于泛基因组图谱进行的全基因组关联分析，发现了143个重要农艺性状相关联的变异位点，并挖掘到与产量性状相关的候选基因446个。
针对这项研究，黄琳凯教授表示，有了这些成果，就可以加速攻关牧草业各环节“卡脖子”技术，培育突破性牧草优良品种，助力提升优质安全食物的供给保障能力，避免“人畜争粮”，为保卫国家粮食安全贡献草业人的力量。
成都日报锦观新闻 记者 魏捷仪 图片 四川农业大学 责任编辑 何齐铁 编辑 刘永豪